深圳国家基因库成全球共享流感数据倡议组织中国首个正式授权机构

3年11月11日，世界卫生组织(世卫组织)宣布2019年冠状病毒病(COVID-19)具有全球性大流行特征3月16日，深圳国家基因库(以下简称国家基因库)与全球流感数据共享倡议(GISAID)达成战略合作国家基因库重要大数据平台(CNGBdb)已成为广交会在中国的第一个官方授权平台GISAID成立于2008年，是目前世界上最大的流感和新型冠状病毒数据平台。中国在抗击非典、甲型HIN1流感、人类感染H7N9禽流感和COVID-19方面发挥了重要作用。目前，世界各地的研究团队正在共同努力，积极开展新型冠状病毒的相关研究，包括病毒的自然史、流行病学、疫苗、诊断试剂、治疗工具等。这一战略合作将有助于中国科研人员获得一站式病毒数据资源访问服务和更丰富的分析工具。这也标志着中国科研机构在遵守法律和保护数据生产者和提交者权利的前提下，推动全球共享新型冠状病毒和流感数据的重要一步。科学防控

疫情需要全球共享病毒数据。全球共享与

呼吸道传染病相关的病毒数据对于保护人类健康至关重要特别是在疫情爆发期间，病毒数据的快速共享可以为评估疫情风险、启动公共卫生应对措施和制定医疗对策提供依据。

近年来，由病毒引起的呼吸道传染病在全球范围内频繁发生，其中甲型H1N1流感在2009年造成约1517，000 ~ 5755，000人死亡，COVID-19在2019年继续威胁人类健康3月11日，世卫组织宣布COVID-19具有全球大流行的特征。截至北京时间3月14日17: 00，中国以外的135个国家和地区报告了61518例COVID-19确诊病例，其中2199例死亡。

截至3月13日，美国国家生物技术信息中心(NCBI)图书馆已收集了800多篇关于各种新型冠状病毒的研究文章。中国临床试验注册中心网站上的新型冠状病毒临床研究索引显示了393个注册的实验。

国家基因库与GISAID

共同推动病毒数据全球共享为共同推动呼吸道传染病相关病毒的全球研究，国家基因库与GISAID达成战略合作。双方将在基因数据管理、呼吸道传染病相关病毒共享和分析等方面开展全面合作，推动病毒数据全球共享。

全球流感数据共享倡议倡导的数据共享机制在维护全球公共安全方面发挥着重要作用。通过几乎实时的监测，季节性流感和全球大流行性流感，以及当前全球流行的新型冠状病毒，都可以得到快速的反应和缓解。GISAID的数据来自全球14，000名研究人员和1，500家机构，其独特的数据共享机制可以促进相关研究的快速进展，如促进对COVID-19的认知和相关医疗对策的研发。GISAID为新型冠状病毒开发的EpiCoV数据库包括656种新型冠状病毒系列数据(截至3月13日)，超过了传统数据平台。与此同时，传统数据平台(如公共领域的数据库)不保护数据所有者的权益，并且由于匿名访问，数据使用不透明，这在GISAID的数据共享机制中已不复存在。

CNG BDB-吉赛德镜像数据库

深圳国家基因库(CNGB)是中国第一个国家综合基因库，也是国家主要科技基础设施之一。2011年，国家发展和改革委员会、财政部、工业和信息化部以及卫生委员会(原卫生部)批准了该项目的建设。在以国家发展改革委和深圳市政府为联合主管单位的理事会指导下，建立了一个贯穿遗传资源“保存(生物样本资源库、活动植物资源库、生物信息库)、读取(数字平台)和写入(基因合成与编辑平台)”能力的公益性、开放性、领先性和战略性科技平台

在生命科学已经进入大数据时代的背景下，国家基因库生命大数据平台(CNGBdb)(学习更多)是中国最大的生物大数据中心之一。它从国家基因库和世界上其他重要的数据源收集公共数据。同时，它提供多种应用工具，如可信共享计算平台，致力于为科研人员提供生物大数据共享和应用服务。在这场新的冠状病毒疫情中，CNGBdb平台从国家基因库和NCBI收集了159个病毒序列数据资源(截至3月13日)，帮助研究人员快速发现、检索和分析病毒

据报道，中国国家生物多样性数据库(CNGBdb)作为GISAID的官方授权平台，将秉承GISAID的数据共享理念，维护数据生产者和数据提交者的权利，为国内科技成果的发布搭建便捷的渠道，并与GISAID共同推进全球病毒基因组序列及相关信息资源可信共享机制的建设。

新数据服务体验有助于呼吸道传染病研究

一站式获取最全面的数据信息

CNGBdb为用户提供一站式数据访问服务，其中将包括GISAID、NCBI和CNGB的病毒数据，并保持它们同步更新从现在起，用户可以登录中国北斗星病毒数据库(https://db.cngb.org/virus/)查看/下载新的冠状病毒数据信息

便捷GISAID接入

CNGBdb建立GISAID“镜像站”(https://db.cngb.org/gisaid/)，为国内用户提供便捷的中英文GISAID接入通道，全面提高接入和数据下载速度

实时动态数据分析

CNGBdb开发并推出了一个多方安全联合计算工具，用于新冠状病毒基因组，该工具基于GISAID使用的Nextstrain(实时可视化工具)，用于促进病毒基因组数据共享、跟踪病毒进化和监控新突变

国家基因库长期致力于建立全球生命资源合作网络。与GISAID的这一合作将进一步推动全球生命大数据资源可信共享机制的建设，并有助于各国共同应对全球健康挑战，共同建设人类命运共同体。

参考:

1。柳叶刀——https://www.who.int/

2.:的传染病甲型H1N1流感的死亡人数远远高于之前的估计，[J]。现代生物医学进展，2012。12(32):I0002-I0002.

3 . https://www . NCBI . NLM . NIH . gov/gen bank/SARS-cov

4 . http://www . chict r . org . cn/index . aspx

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