新技术实现固定组织中蛋白质和RNA的多重数字空间分析

最后更新：2020-05-13 09:51:53 手机定位技术交流文章

作者小珂

约瑟夫·比彻姆、克里斯托弗·梅里特和美国纳米串技术公司的其他研究人员合作开发了一种固定组织中蛋白质和核糖核酸的多数空分析技术。

研究结果发表在2020年5月11日的《自然-生物技术》杂志上。

研究人员开发的数字空间期分析是一种适用于福尔马林固定和石蜡包埋(FFPE)样品的蛋白质或核糖核酸空间期分析方法。

该方法依赖于(1)使用寡核苷酸标签多次读取蛋白质或核糖核酸；(2)通过光裂解接头连接到亲和试剂(抗体或核糖核酸探针)的寡核苷酸标签；(3)将剪切光投射到组织样品上，以用聚碳酸酯寡核苷酸以任何空模式释放覆盖1至5，000个细胞的目标区域(ROI)。

数字信号处理器可以利用抗体读数来获得感兴趣区域内的单细胞灵敏度，而核糖核酸检测可以应用于大约600个单个的核糖核酸转录本。

研究人员通过使用计数系统空图谱分析，在淋巴、结肠直肠肿瘤和自身免疫组织中显示了多达44种蛋白质和96种基因(928种核糖核酸探针)，通过使用下一代测序(NGS)，显示了1，412种基因(4，998种核糖核酸探针)。

数字信号处理器不仅可用于分析生物文库样本中的蛋白质和核糖核酸，还可用于分析患者样本中的免疫标记，这有可能影响临床决策。